Täydennysrakentamiseen tavallaan jo valmiiseen kaupunkirakenteeseen liittyy tietysti ongelmia. Ensimmäinen kysymys on siksi, saavutetaanko rakentamisella ekologisen hyödyn lisäksi mitään muuta. Näin ei aina ole, mutta Kalliossa, etenkin Linjoilla, on muutamia kohtia, joissa kaupunkirakenne on mm. 1960-luvun rakentamisperiaatteiden jäljiltä ruma ja pirstoutunut.